对于新冠病毒的起源,始终存有各种各样的争议,最近有一项研究,是依据病毒突变进行分析的,提出了和早期认知不一样的观点,这引发了广泛的讨论。
研究采用的分析方法
该研究剖析了在2019年12月起始至2020年7月结束这个时间段内所募集的4571个新冠病毒基因组序列。研究工作者把这些序列划分成为2449个各异的病毒株或者子集。分析是依据一个核心的准则来进行的:在进化的进程当中,那些突变数量最少的毒株是最为靠近所有毒株的共同祖先的。这样的一种方法在生物学的研究领域当中被称作简约原则。
为了确定源头所在之处,研究不光查看突变的数量,还将毒株的全球地理分布情况予以结合。要是某一个地区的毒株具有较高的多样性,那就表明病毒于该地进行传播以及演化的时间兴许会更长久。运用这种把突变谱跟多样性分析相互结合的方法,目的在于能够提供更为全面的线索。
武汉毒株并非突变最少
有所研究发现,于武汉进行首次测序并予以公布的NC_045512毒株,并非是全球发生突变数量最少的毒株。在针对数据展开分析的过程当中,存在着41个毒株,其全基因组的点突变数量相较于武汉毒株而言更少。这些在突变方面处于最少情况的毒株,在四大洲的八个不同国家呈现出分散分布的状态。
鉴于新冠病毒自身的突变率相对较低,假使一个毒株成为了其余所有毒株的祖先,从理论上来说,它理应维持最接近于原始状态。武汉毒株不是“最少突变株”的这一发觉,直接对其作为全球传播起始点的假定发起了挑战。
阳性选择位点的发现
对病毒的五个基因展开研究,从中识别出八个阳性选择位点,阳性选择的意思是存在这样一些突变,这些突变由于能够助力病毒在适应宿主方面取得更好效果从而被留存下来,经过分析表明,在那些突变数量较少的早期毒株里其中四个阳性选择位点就已然存在。
那些处在较早时候出现的阳性选择事件,按理说有可能协助病毒达成在区别各异的宿主之间跳跃,又或者对人类群体实现了更好的适应。有一部分选择位点主要是在跟美国有所关联的毒株里出现的,而另外那一些却是和欧洲毒株存在关联的,这就明白表明了早期传播路径具备的复杂性。
印度次大陆的毒株多样性最高
进行了统计分析,对各国毒株的多样性予以比较。研究有发现,在印度和孟加拉国所处的印度次大陆,该地区的毒株多样性指数明显高于其他地区。具体呈现出这样的情况,这两个国家的毒株种类数量,远远高于它们所提交的基因序列数量在全球所占的比例。
一般而言,高多样性常常被视作病毒于该地区传播时长较久的一种标志。与之形成对照的是,美国所提交的序列数量虽多,然而毒株种类相对而言较为单一,多样性处于较低水平。正是这一项用以证明之事,将最早出现人传人现象一地的可能性指向了印度次大陆。
时间推算早于武汉疫情
研究人员依据估算出的新冠病毒年均突变率,展开了回溯计算,推算出的结果表明,病毒于人类宿主里开始传播的时间,大概处于2019年7月至8月这个阶段,此时间比2019年12月武汉正式报告疫情病例的时间早了大概四至五个月。
这个时间线是依据病毒积累的突变数量反向推断而得出的,它为病毒的隐性传播期给予了数据参考,它显示,在武汉被发觉以前,病毒或许已然在别的地区暗暗传播了好多月。
研究的局限与意义
要明确指出的是,此项研究是建立在早期数量有限的基因组数据基础之上的,因而其得出的结论并非是最终确定无疑的论断。病毒起源属于一个极为复杂的科学方面的问题,这需要多条线索的证据相互进行证实。仅仅凭借基因序列以及进化模型分析是存在不确定状况的。
然而,此项研究为新冠病毒早期传播的理解给出了新视角,它着重突出了开展广泛、持续国际基因组监测的重要意义,还提示大家,疫情的最初报告地点并非等同于病毒的发源地方,这为往后全球合作应对大流行病给予了新的思考方向。
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